环境工程微生物学是列入我国高校环境类专业培养计划中的一门必修专业或专业基础课。课程主要讲述环境 工程污（废）水及有机固体废物处理和水体及土壤污染与 自净过程中涉及到的主要微生物的形态与结构、新陈 代谢与生长繁殖、微生物在物质循环和污水生物处理中的净化作用及机理，有害/有益微生物的控制等。