水资源系统优化原理与方法的思政教育目标是要让学生建立一种科学思维方式，用辩证和历史唯物主义的观点去观察和分析问题，培养其规则意识和约束观念，以社会主义核心价值观来进行价值定位。将马克思主义的认识论、方法论和实践论融入专业知识的学习之中，由实际复杂水资源系统→概化为抽象系统→构建数学模型→计算机程序设计→求解并验证模型的适用性→修改和完善数学模型等过程，培养学生一种认识和分析以及解决问题的基本素养，提高学生运用马克思主义的辩证观点去领悟科学研究的内涵。教学过程中通常采用研究型教学方式，以知识为载体，传授相关的思想和方法，鼓励学生养成探索的习惯，从实际问题入手，力求理论与实践的辩证统一。